Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms