Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms