Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA3Q08378 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA3Q08378 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA3Q08378 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA3Q08378 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA3Q08378 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms