Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms