Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms