Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms