Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms