Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2FP61218 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms