Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms