Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCKAP1LP55160 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms