Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNBP48739 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNBP48739 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNBP48739 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms