Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2AP42771 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2AP42771 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2AP42771 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms