Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms