Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRABP1P29762 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRABP1P29762 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms