Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms