Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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