Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms