Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TYMSP04818 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TYMSP04818 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TYMSP04818 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TYMSP04818 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TYMSP04818 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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