Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATBO75879 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATBO75879 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATBO75879 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms