Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms