Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN6O00399 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN6O00399 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN6O00399 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms