Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms