Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms