Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms