Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF639Q9UID6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF639Q9UID6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms