Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms