Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NLKQ9UBE8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NLKQ9UBE8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms