Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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