Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms