Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMC2Q9NRP2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms