Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms