Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms