Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBCK1Q9BYM8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms