Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms