Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TINF2Q9BSI4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms