Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3CQ99985 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms