Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms