Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms