Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms