Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms