Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms