Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCTN3Q6NUS6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms