Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms