Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms