Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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