Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRD3Q15059 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms