Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms