Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BECN1Q14457 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BECN1Q14457 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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