Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms