Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms